В 2000 году, в год своего 70-летия, АГТУ был награжден почетным знаком Российской Академии естественных наук – «За пользу Отечеству», а также включен в сотню лучших вузов России.
К десятилетию в статусе университета в 2004 году вуз насчитывал 60 кафедр, вел обучение по 41 специальности, а общая численность студентов возросло до 10, 5 тыс. человек.
В сентябре 2002 года АГТУ принял участие в Генеральной Ассамблее Ассоциации университетов Прикаспийских государств.
Активно развивался спорт – свыше 40 студентов стали мастерами спорта, многие впоследствии стали мастерами спорта международного класса. Студенты АГТУ принесли спортивную славу не только вузу, но и стране. Среди них – чемпионы России по кик-боксингу, чемпионы Европы и мира по спортивным танцам, трехкратный чемпион мира по самбо, абсолютный чемпион Европы по спортивной акробатике. Студенты АГТУ входили в состав Олимпийской сборной России по гандболу.
Важным направлением развития вуза стало обеспечение высокого уровня подготовки высококвалифицированных кадров и интеграция в международное образовательное пространство. В 2004-2005 гг. в АГТУ была разработана и внедрена система менеджмента качества на основе международных стандартов ISO 9000:2001.